genetic diversity evaluation of a medicinal plant (ziziphora tenuior.l) of iran, using rapd molecular markers

[ ' z i z i p h o r a t e n u i o r ' , ' n a m e d k a k o o t i i n f a r s i ' , ' i s o n e o f t h e a r o m a t i c a n d m e d i c i n a l p l a n t s o f a w i d e d i s t r i b u t i o n i n i r a n . i n t h i s s t u d y ' , ' r a p d m o l e c u l a r m a r k e r s ' , ' ( b y u t i l i z a t i o n o f 1 6 p r i m e r s ) w a s a p p l i e d t o d e t e r m i n e t h e g e n e t i c d i v e r s i t y o f 3 9 s a m p l e s o f z i z i p h o r a t e n u i o r f r o m 2 1 g e o g r a p h i c a l r e g i o n s i n i r a n . a n u m b e r o f 1 0 0 p o l y m o r p h i c b a n d s o u t o f 1 1 0 a m p l i f i e d o n e s w a s p r o d u c e d a n d a n a l y z e d t h r o u g h n t s y s s o f t w a r e . j a c c a r d & a p o s ; s s i m i l a r i t y c o e f f i c i e n t w a s e m p l o y e d t o c a l c u l a t e s i m i l a r i t i e s a m o n g t h e s a m p l e s . c a l c u l a t e d s i m i l a r i t y b a s e d o n t h e p o l y m o r p h i c b a n d s ' , ' s t o o d i n t h e r a n g e o f 0 . 1 9 t o 0 . 7 7 w i t h a m e a n o f 0 . 4 3 . m o s t a m p l i f i e d p o l y m o r p h i c f r a g m e n t s ( 1 2 ) w e r e r e l a t e d t o t h e p r i m e r t i b m b a ' , 6 , ' w h i l e t h e p r i m e r t i b m b b ' , ' 1 3 c a r r i e d t h e l o w e s t ( 3 ) a m p l i f i e d p o l y m o r p h i c b a n d s . m e a n n u m b e r o f a m p l i f i e d b a n d s f o r p r i m e r s w a s 6 . 9 ' , ' w h i l e t h e m e a n n u m b e r o f p o l y m o r p h i c b a n d s w a s 6 . 3 . c l u s t e r a n a l y s i s w a s p e r f o r m e d b a s e d u p o n s i m i l a r i t y m a t r i x a n d u p g m a m e t h o d . a c c o r d i n g t o c l u s t e r a n a l y s i s w i t h i n t h e s i m i l a r i t y c o e f f i c i e n t o f 0 . 4 3 ' , ' z i z i p h o r a s a m p l e s w e r e d i v i d e d i n t o 6 g r o u p s . b a s e d u p o n s i m i l a r i t y m a t r i x ' , ' t h e l o w e s t s i m i l a r i t y ( 0 . 1 9 ) w a s f o u n d f o r t w o s a m p l e s f r o m m a s h h a d a n d e s l a m i e h y a z d w i t h h i g h g e o g r a p h i c a l d i s t a n c e w h i l s t t h e h i g h e s t s i m i l a r i t y ( 0 . 7 7 ) f o u n d b e t w e e n t w o s a m p l e s f r o m y a s u j w i t h i n t h e s a m e g e o g r a p h i c a l r e g i o n . t h e r e s u l t s f i n a l l y i n d i c a t e d h i g h g e n e t i c d i v e r s i t y a m o n g t h e s t u d i e d g e n o t y p e s . ' ]